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標(biāo)準(zhǔn)版

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第四節(jié) 載脂蛋白CⅢ基因型檢測

《動脈粥樣硬化》

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  載脂蛋白CⅢ基因位于11號染色體與載脂蛋白AⅠ-AⅣ形成一基因族,,它位于載脂蛋白AⅠ下游,,有三個內(nèi)含子和四個外顯子。目前對載脂蛋白CⅢ基因3'末端非編碼區(qū)C-G對換產(chǎn)生一個Sac-Ⅰ酶切位點與冠心病的關(guān)系未有定論,。用多聚酶鏈反應(yīng)(PCR)擴增載脂蛋白CⅢ基因3'末端233bp,,再用Sac-1酶切擴增產(chǎn)物,可以檢測載脂蛋白CⅢ基因3'末端的突變及其與動脈粥樣硬化相關(guān)性,。本節(jié)采用PCR-RFLP檢測ApoCⅢ基因型,。

  一、儀器與試劑

  1.儀器:電泳儀,,基因擴增儀,。

  2.試劑:TaqDNA聚合酶,,dNTP,DNA參考物,,Sca-1酶,。

  二、操作方法

  1.模DNA提取

  取用EDTA抗凝全血100μl加試劑(0.32mol/L蔗糖,,5mmol/l MgCl2,1%TritonX-100,0.01mol/L Tris-HClpH7.6),,振搖至溶解均勻透明,3000r/min離心10min,棄上清,,沉淀部分加0.9NaCl溶液洗一次,,加預(yù)冷試劑Ⅱ(75mmol/l NaCl,24mmol/L EDTA)100μl,20%SDS15μl,,蛋白酶K10μl(6g/L)于65℃水浴4h,,加200μl酚和氯仿:異戊醇(24:1)各提兩次,上清加無水乙醇1.0ml放置于-20℃2h,,以12kr/min離心5min,,真空干燥后加50μlTE緩沖液溶解,4℃保存?zhèn)溆谩?/p>

  2.多聚酶鏈反應(yīng)

  Primer1:5'-GTGACC GAT GGC TTC AGT TCC CTG-3',,primer2:5'-GGt AGG AGAGCA CTC AGA ATA CA-3',。反應(yīng)總體積為50μl,擴增緩沖液所含物質(zhì)終濃度為:Tris-HCl,,pH8.3,,67mmol/L;MgCl225mmol/L;KCl 50mmol/L;明膠0.01%,dNTP各0.2~0.5μmol/L,,模板約10μg,,加40μl液體石蠟,94℃預(yù)變性4min,,加Tag聚合酶1.5U,,以93℃1min、65℃1.5min,、72℃1.5min,循環(huán)30次,。

  3.擴增產(chǎn)物酶切

  取擴增產(chǎn)物20μl加入NH4AC20μl,,再加300μl無水乙醇混均置-20℃1h,10000r/min離心7min棄上清,,干燥后加Sac-1酶液10μl37℃保溫2h,。

  4.擴增產(chǎn)物堿基對分子量測定

  采用GB公司產(chǎn)DNamarker,以已知DNA片段bp數(shù)相對應(yīng)的電泳遷移距離,取半對數(shù)作圖制成標(biāo)準(zhǔn)曲線,,再根據(jù)等測定擴增產(chǎn)物DNA片段移動距離在標(biāo)準(zhǔn)曲線上求出其bp數(shù),。

  三,、結(jié)果分析

  采用本節(jié)設(shè)計引物擴增產(chǎn)物為ApoCⅢ基因3'非編碼區(qū)233bp,該產(chǎn)物經(jīng)Sac-1酶切可出現(xiàn)三種結(jié)果;①酶切后仍為一條帶,,電泳遷移率未發(fā)生改變,,為S1S1純合子;②酶切后除原始帶外又增加了兩條帶,查標(biāo)準(zhǔn)DNa marker曲線在158bp和75bp相同,,為S2S2雜合子;③酶切后原始帶消失,,出現(xiàn)兩條新帶,其電泳遷移率與158bp和75bp相同,,為S2S2純合子,。S2為擴增的基因產(chǎn)物中C-G對換增加一個酶切位點。

  檢查100名正常人中有S2雜合子28名,,純合子2名;68名冠心病人中S2雜合16名,,純合子4名,它們的頻率變化見表(19-4),。S2基因頻率兩組間無明顯差別,。

  表19-4 載脂蛋白CⅢ基因Sac-Ⅰ酶切頻率表

  級別n基因型頻 率

  S1S1S1S2S2S2S1S2

  正常人100702820.840.16

  冠心病68481640.820.176

  X=0.079,p>0.05(兩組比較)

  (徐瓊)

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